1、技术风险：蜜蜂养殖对相关技术的要求是非常高的，事实上很多人养蜂失败都是因技术不过关而导致的，例如蜂群意外失王后若不及时为其介入新蜂王则整个蜂群都会灭亡，又如发生自然分蜂时若不及时处理极易出现损失蜂群的情况，再如在蜂群管理中若不注意卫生和消毒工作则极易导致蜂群患病甚至可能波及全场。
2、气候不适：蜜蜂养殖几乎可以说是靠天吃饭的行业，而天气变化又是完全是不受人为控制的，若大流蜜期遇到连续雨天蜜蜂根本无法出巢采集花蜜，一年主要的几个大流蜜期都是这种天气基本上就白忙活了一年，另外蜜源植物泌蜜是多还是少也会受到气候的影响，因此对养蜂人而言大流蜜期遇到连续晴天就是烧高香了。
3、蜂群患病：蜜蜂养殖同样绕不开病虫害上面的风险，一旦蜂群患病轻者群势和生产力都将受到影响，严重时甚至可能导致蜂群灭亡或弃巢而逃，更麻烦的是蜜蜂基本很多都是传染病，也就是说一群蜂患病不及时处理极有可能导致全场蜂都患病，事实上很多颇具规模的养蜂场都是因病害严重且得不到有效处理而被拖垮的。
4、农药中毒：蜜源植物分泌的花蜜是蜜蜂酿蜜的原料，但实际上很多蜜源植物都是农民种植的农作物，农民在病虫害高发期为了保护农作物往往会喷洒农药，因此蜜蜂采集喷洒农药的蜜源而中毒的事情也常有发生，农药中毒轻时会使蜂群元气大伤并影响养蜂的效益，而农药中毒严重时甚至整个蜂群在1～2天内便全群死亡。
5、蜂蜜滞销：蜜蜂养殖的主要产品是蜜蜂酿制的蜂蜜，养蜂人只有将这些蜂蜜销售出去之后才能获取效益，虽然很多养蜂人可能都发展得有相对固定的销售渠道，但很多蜂蜜收购商在收购蜂蜜时往往也会大幅度的压价，此时养蜂人面临的问题要么是低价卖给蜂蜜收购商，要么这些积存的蜂蜜便因无法及时销售出去而滞销。
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